《促進個體工商戶發展條例》用7條的篇幅規定了保護個體工商戶合法權益的各項內容，較原《個體工商戶條例》有了明顯的進步。
一、禁止亂收費、亂攤派（第三十條）。這方面規定在原《個體工商戶條例》中已有體現，新條例做了擴充，涵蓋了違反規定對個體工商戶進行收費、攤派的各種形式，主體也由“任何部門和單位”擴展到“任何單位和個人”。針對個別領域出現的要求勞動者登記為個體工商戶，以逃避雇主責任的現象，《條例》專門規定，任何單位和個人不得誘導、強迫勞動者登記注冊為個體工商戶，有效保障勞動者合法權益。 二、禁止拖欠賬款（第三十一條）。大企業利用優勢地位拖欠中小企業賬款，是近年來政府重點治理的問題。為此，2020年國務院專門制定出臺了《保障中小企業款項支付條例》。對個體工商戶而言，拖欠賬款的情況也時有發生，并且個體工商戶相比中小企業更為弱勢，應當從法律層面加強保護。《條例》明確規定，機關、企業事業單位不得對個體工商戶強加不合理交易條件，不得違約拖欠或者變相拖欠個體工商戶賬款。通過這一規定，將禁止拖欠個體工商戶賬款作為法律義務明確下來。 三、禁止設置指標（第三十二條）。個體工商戶是個人經營意愿的體現，個體工商戶數量增長應當是營商環境不斷優化的結果，政府部門不應“拔苗助長”，不切實際地設置個體工商戶數量增長目標，甚至作為績效考核指標。同樣，年度報告是個體工商戶依法公示經營信息、提升信用水平的有效途徑，應當反映個體工商戶生存的真實情況。《條例》針對個別地方出現的片面追求個體工商戶“數字”的情況，專門強調縣級以上地方人民政府應當提升個體工商戶發展質量，不得將個體工商戶數量增長率、年度報告率等作為績效考核評價指標。 四、投訴舉報（第三十三條）。本條規定了個體工商戶對侵害自身合法權益的行為，有投訴、舉報的權利。縣級以上地方人民政府及其有關部門應當暢通投訴、舉報途徑，并依法及時處理。投訴舉報途徑的暢通對保護個體工商戶合法權益至關重要。 五、守法誠信經營（第三十四條）。守法誠信經營是個體工商戶的義務，也是其穩定經營、長期發展的基本保障。《條例》對個體工商戶依法經營、誠實守信，自覺履行相關法定義務作出了明確規定。同時對食品藥品、特種設備等涉及公共安全和人民群眾生命健康等重點領域，強調了加強監督管理、維護良好市場秩序。這充分體現了《條例》放管結合、服務發展與依法監管相統一的立法理念。 六、處罰原則（第三十五條）。教育和懲戒相結合、過罰相當是《行政處罰法》的明確規定，也是行政執法的基本原則。對小本經營的個體工商戶而言，堅持這一原則更為重要。《條例》明確，個體工商戶開展經營活動違反有關法律規定的，有關行政部門應當按照教育和懲戒相結合、過罰相當的原則，依法予以處理。 七、行政追責（第三十六條）。本條是對政府及其有關部門工作人員不作為、亂作為，損害個體工商戶合法權益的禁止性規定，也是保護個體工商戶合法權益的重要方面。
